在有机食品生产中使用商品有机肥时要注意：市场上的商品有机肥很多，据了解，许多均不是名副其实的。

对于外购的商品有机肥用于有机食品生产，有机标准是有规定的，要通过有机认证或经认证机构许可。对于未经认证的商品有机肥的使用，必须首先获得认证机构的认可，申请者往往在使用时会忽视事先申报报，因此，检查员在检查时会将外购商品肥作为重点检查对象之一。

凡是氮、磷、钾含量过高，一般情况下如果总量超过6%，特别是超过8%的，必须调查清楚其成分，尤其要了解是否要掺有化肥的复合肥。所以，为了满足有机食品生产的应用，有机肥料加工厂可以多选用一些养分含量较高的大豆饼、花生饼等堆制有机肥料，从而提高氮磷钾含量。

对于农场向邻近农民或养殖场购的非商品化有机肥（农家肥或堆肥）的成分和堆制过程是否符合标准的规定，一则是要生产者自己注意控制，二则检查员在检查现场也可以依据认证机构的评估规定进行判断。